Новый тест обнаружит 416 тропических вирусов

Учeныe из брaзильскoгo Унивeрситeтa Сaн-Пaулу (University of São Paulo) рaзрaбoтaли нoвую плaтфoрму для oбнaружeния зaбoлeвaний. С ee пoмoщью пo aнaлизaм мoжнo oпрeдeлить 416 рaзличныx вирусoв, встрeчaющиxся в трoпичeскиx рeгиoнax мирa. Пo слoвaм сoздaтeлeй плaтфoрмы, кooрдинирoвaл кoтoрыx прoфeссoр Виктoр Xугo Aквинo (Victor Hugo Aquino), плaтфoрму мoжнo будeт испoльзoвaть в лaбoрaтoрияx при рaбoтe спeциaлистoв, нaблюдaющиx зa вирусaми, спoсoбными пoтeнциaльнo вызвaть эпидeмию.

Прoфeссoр Aквинo oтмeтил, чтo с приxoдoм лeтa числo пaциeнтoв, у кoтoрыx будут пoдoзрeвaть вирусы дeнгe, Зикa или чикунгуньи, будет расти. Традиционные методы часто не могут помочь при уточнении диагноза, поэтому врачи могут затрудняться с определением того, какой же вирус циркулирует в какой-либо момент времени. Если бы разработка бразильцев использовалась в начале эпидемии вируса Зика, как считает Виктор Аквино, возможно, распространение болезни ограничилось бы местностью, где она началась — так как пока специалисты определили, что во всем виноват определенный вирус, заболевание поразило уже большое количество людей.

Читайте еще:

Обнаружен неизвестный ранее вирус

Ученые из Исследовательского института инфекционных заболеваний Вооруженных сил США (US Army Medical Research Institute of Infectious Diseases) обнаружили неизвестный ранее вирус с необычными свойствами. Вирус Guaico Culex (GCXV) – мультикомпонентный вирус, который был обнаружен в организме комаров. Ранее считалось, что мультикомпонентные вирусы способны заражать лишь растения и грибы. Сейчас же Guaico Culex был найден у комаров, обитающих в Тринидаде. Его обнаружили при изучении вирусов, переносимых комарами. Такие исследования проводились в целях предотвращения эпидемий, подобных эпидемии вируса Зика в Бразилии.

Платформа воспринимает не только общеизвестные вирусы, но и такие, которые встречаются только спорадически, так как и они могут вызвать эпидемию. Это, например, вирус Майяра — «родственник» чикунгуньи — или вирус Оропуч. По словам профессора Аквино, есть и другие вирусы, которые пока не проявили себя среди людей. Разработка ученых определяет вирусы, переносимые не только членистоногими (комарами, клещами), но и небольшими млекопитающими (например, хантавирус переносится крысами и мышами).

Само устройство состоит из панели, разделенной на 8 подпанелей, и содержит 15 тысяч вирусных проб. Каждая из проб повторяется как минимум трижды и состоит из 60 нуклеотидов, способных связываться с определенным вирусом. Для создания платформы бразильские ученые использовали базу данных GenBank, принадлежащую Национальной медицинской библиотеке США (United States National Library of Medicine). Если образец крови содержит один из 416 вирусов, на обнаружение которых запрограммирована платформа, геном этого вируса совместно с определенной нуклеотидной последовательностью образует маркер, который можно будет заметить с помощью сканера — такого же, какой используется для анализа экспрессии генов.

Изделие имеет достаточно высокую стоимость, поэтому использовать его будут только в крайних случаях — когда обычные методы определения патогена не помогут. Платформу уже протестировали с использованием 20 образцов вирусов, имевшихся в лаборатории Университета Сан-Паулу, и устройство оказалось достаточно эффективно — в том числе в определении в крови пациента двух вирусов сразу.

Источник:

New test can diagnose 416 viruses from tropical regions

Researchers from the University of São Paulo (USP) at Ribeirão Preto in Brazil have developed a platform that analyzes clinical samples from patients to diagnose infection by 416 viruses found in the world's tropical regions. According to its creators, the tool can be used by reference laboratories such as Adolfo Lutz Institute, Oswaldo Cruz Foundation (Fiocruz) and Evandro Chagas Institute in Brazil to assist epidemiological surveillance by detecting pathogens with the potential to cause epidemics in humans. Results of the research project, which was coordinated by Victor Hugo Aquino, a professor at the University of São Paulo's Ribeirão Preto Pharmaceutical School (FCFRP-USP), and supported by FAPESP, have been published in PLoS Neglected Tropical Diseases.

Medical Xpress